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Facio(模擬分子結(jié)構(gòu)的軟件)是一款以質(zhì)量高,靈活易操作而聞名的分子模擬軟件。通過3D對量子化學(xué)計(jì)算,分子力學(xué)及動力學(xué)進(jìn)行模擬。Hyperchem為您提供比其它Windows軟件更多的模擬工具: 圖形界面,半經(jīng)驗(yàn)計(jì)算方法(AM1,PM3等),UHF,RHF和CI,7.0版新增加的密度泛函?蛇M(jìn)行單點(diǎn)能,幾何優(yōu)化,分子軌道分析,蒙特卡羅和分子力學(xué)計(jì)算,預(yù)測可見-紫外光譜。
Facio(模擬分子結(jié)構(gòu)的軟件)軟件是一款在創(chuàng)建、顯示和操作各種晶體分子結(jié)構(gòu)中屢獲好評的軟件。CrystalMaker在生產(chǎn)力方面提供了一個(gè)流線型的工作流程,您只需把您的數(shù)據(jù)文件拖拉到程序中便可即時(shí)顯示照片般逼真的色彩。用鼠標(biāo)就可以實(shí)時(shí)操作晶體結(jié)構(gòu)。多視角"bookmarks"和撤銷次數(shù)鼓勵(lì)您探索和發(fā)現(xiàn)——理想的教學(xué)和科研軟件。
1. 結(jié)構(gòu)輸入和對分子操作。
2. 顯示分子。
3. 化學(xué)計(jì)算。用量子化學(xué)或經(jīng)典勢能曲面方法,進(jìn)行單點(diǎn)丶幾何優(yōu)化和過渡態(tài)尋找計(jì)算?梢赃M(jìn)行的計(jì)算類型有:單點(diǎn)能,幾何優(yōu)化,計(jì)算振動頻率得到簡正模式,過渡態(tài)尋找,分子動力學(xué)模擬,Langevin動力學(xué)模擬,Metropolis Monte Carlo模擬。支持的計(jì)算方法有:從頭計(jì)算,半經(jīng)驗(yàn)方法,分子力學(xué),混合計(jì)算等。
4. 可以用來研究的分子特性有:同位素的相對穩(wěn)定性,生成熱,活化能,原子電荷,HOMO-LUMO能隙,電離勢,電子親和力,偶極矩,電子能級,MP2電子相關(guān)能,CI激發(fā)態(tài)能量,過渡態(tài)結(jié)構(gòu)和能量,非鍵相互作用能,UV-VIS吸收譜,IR吸收譜,同位素對振動的影響,對結(jié)構(gòu)特性的碰撞影響,團(tuán)簇的穩(wěn)定性。
5. 支持用戶定制的外部程序。
6. 其它模塊:RAYTRACE模塊,RMS Fit,SEQUENCE編輯器,晶體構(gòu)造器糖類構(gòu)造器,構(gòu)像搜尋,QSAR特性,腳本編輯器。
7. 新的力場方法:Amber 2,Amber 3,用于糖類的Amber,Amber 94,Amber 96。
8. ESR譜。
9. 電極化率。
10. 二維和三維勢能圖。
11. 蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)。
12. 電場。
13. 梯度的圖形顯示。
14. 新增功能:密度泛函理論(DFT)計(jì)算,NMR模擬,數(shù)據(jù)庫,Charmm蛋白質(zhì)模擬,半經(jīng)驗(yàn)方法TNDO,磁場中分子計(jì)算,激發(fā)態(tài)幾何優(yōu)化,MP2相關(guān)結(jié)構(gòu)優(yōu)化,新的芳香環(huán)圖,交互式參數(shù)控制,增強(qiáng)的聚合物構(gòu)造功能,新增基組。
分子結(jié)構(gòu),或稱分子立體結(jié)構(gòu)、分子形狀、分子幾何,建立在光譜學(xué)數(shù)據(jù)之上,用以描述分子中原子的三維排列方式。分子結(jié)構(gòu)在很大程度上影響了化學(xué)物質(zhì)的反應(yīng)性、極性、相態(tài)、顏色、磁性和生物活性。分子結(jié)構(gòu)涉及原子在空間中的位置,與鍵結(jié)的化學(xué)鍵種類有關(guān),包括鍵長、鍵角以及相鄰三個(gè)鍵之間的二面角。分子的鍵有三種極限類型,即離子鍵、共價(jià)鍵和金屬鍵。