染色體距離大小測算(NucType)是一個方便的應(yīng)用，需要衡量和比較染色體或染色體的生物學(xué)家設(shè)計。 您可以使用應(yīng)用程序，以便測量兩點之間的距離。該方案還可以分析染色體核型不對稱指數(shù)從加載的圖像文件或一個以前保存的項目。GBM紅軟基地

軟件特點

1）已組裝到contig或者scaffold水平的基因組，無論是Sanger測序、二代測序或者三代測序完成的基因組，但是未組裝到染色體水平均可。GBM紅軟基地
2）基因組未知物種，Hi-C與常規(guī)de novo結(jié)合提高基因組組裝水平。GBM紅軟基地

軟件說明

Hi-C之所以能用于基因組組裝，是基于染色質(zhì)片段間的交互強(qiáng)度呈現(xiàn)出隨距離衰減的規(guī)律 Hi-C相互作用強(qiáng)度與距離關(guān)系GBM紅軟基地
與遺傳定律類似，這一規(guī)律可以用來判斷scaffolds的分類及相鄰關(guān)系。分以下三步：聚類—排序—定向（cluster-order-orient）。GBM紅軟基地

相關(guān)介紹

染色體（Chromosome ）是細(xì)胞內(nèi)具有遺傳性質(zhì)的物體，易被堿性染料染成深色，所以叫染色體（染色質(zhì)）；染色體是細(xì)胞核中載有遺傳信息（基因）的物質(zhì)，在顯微鏡下呈圓柱狀或桿狀，主要由脫氧核糖核酸和蛋白質(zhì)組成，在細(xì)胞發(fā)生有絲分裂時期容易被堿性染料（例如龍膽紫和醋酸洋紅）著色，因此而得名。GBM紅軟基地

軟件截圖

 GBM紅軟基地