MOIL(免費(fèi)分子模型建模軟件)，免費(fèi)三維分子模型建模軟件。Quy紅軟基地

軟件介紹

MOIL(免費(fèi)分子模型建模軟件)是一款功能強(qiáng)大的，易于使用的 FBLD（Fragment Based Lead Discovery 基于分子片段的藥物研究）與 SBDD（structure-baseddrugdesign，基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)）平臺(tái)。Quy紅軟基地

軟件功能

1、能量最小計(jì)算：能量最小化計(jì)算考察分子的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)，或通過(guò)軟件提供的MOPAC、Jaguar， GANESS及Gaussian的接口，進(jìn)行從頭計(jì)算或半經(jīng)驗(yàn)計(jì)算，甚至NMR，IR或Raman光譜的預(yù)測(cè)，其中MM2-對(duì)分子進(jìn)行初步的能量最小化計(jì)算，MOPAC-半經(jīng)驗(yàn)算法， MMFF94-12.0版本新增加力場(chǎng)，而GAMESS、 Jaguar好Gaussian-從頭計(jì)算。Quy紅軟基地
2、ChemBio3D能夠計(jì)算分子更多的物化性質(zhì)，以平面進(jìn)行旋轉(zhuǎn)，計(jì)算能量最小構(gòu)造，以下圖為例，圖A是最低能量構(gòu)造側(cè)視圖，圖B是最低能量構(gòu)造俯視圖，圖C是分子所在兩個(gè)平面的夾角對(duì)能量的影響。Quy紅軟基地
三種能量最小構(gòu)造Quy紅軟基地
3、物化性質(zhì)計(jì)算：ChemBio3D可計(jì)算分子更多的物化性質(zhì)。ChemProp Pro包括固有變量計(jì)算，如沸點(diǎn)、臨界壓力、溫度和體積、亨利定律常數(shù)、熔點(diǎn)、蒸汽壓和水溶性等。ChemPro Std包括形式電荷、幾個(gè)Connolly變量、準(zhǔn)確質(zhì)量、橢圓度等。CLogP Driver能夠計(jì)算提供摩爾折射率和分配系數(shù)，支持GAMESS程序接口、Jaguar程序接口、MOPAC程序接口。另外，Molecular Topology可用于測(cè)量分子拓?fù)鋵W(xué)的諸多方面，包括Balaban指數(shù)、Cluster Count、一些旋轉(zhuǎn)鍵、形狀系數(shù)、拓?fù)渲睆胶推渌鼌��?shù)等。Quy紅軟基地

軟件特色

　　1、該分子模型軟件支持生成分子坐標(biāo)（PDB格式）； Quy紅軟基地
　　2、支持設(shè)定電子密度； Quy紅軟基地
　　2、支持MSMS表面數(shù)據(jù)； Quy紅軟基地
　　3、支持apbs靜電勢(shì)圖。Quy紅軟基地

軟件截圖

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