KegArray(微陣列數(shù)據(jù)分析軟件)是一款教育教學(xué)軟件!KegArray(微陣列數(shù)據(jù)分析軟件),其它高通量檢測(high-throughput screen)技術(shù)的興起,無疑將成為本世紀(jì)的主流;微陣列實驗主要的優(yōu)勢在于能同時大量地、全面性地偵測上萬個基因的表達量,通過基因芯片,可在短時間內(nèi)找出可能受疾病影響的基因,作為早期診斷的生物標(biāo)記(biomarker)。
在人類基因組測序計劃的重要里程碑陸續(xù)完成之后,生命科學(xué)邁入了一個前所未有的新時代,在人類染色體總長度約三十億個堿基對中,約含有四萬個基因,這是生物學(xué)家首次以這么宏觀的視野來檢視生命現(xiàn)象,而醫(yī)藥上的研究方針亦從此改觀,科學(xué)研究從此正式進入后基因組時代。
然而,由于這一類技術(shù)的高度自動化、規(guī);拔⑿突奶匦,使得他們所生成的數(shù)據(jù)量非常龐大且數(shù)據(jù)形態(tài)比一般實驗數(shù)據(jù)更加復(fù)雜,因此,傳統(tǒng)統(tǒng)計分析方法已經(jīng)不堪使用。在此同時,統(tǒng)計學(xué)家并未在此重要時刻缺席,提出非常多新的統(tǒng)計理論和方法來分析微陣列實驗數(shù)據(jù),也廣受生物學(xué)家所使用。
由于微陣列數(shù)據(jù)分析所牽涉的統(tǒng)計問題層面相當(dāng)廣且深入,本文僅針對整個實驗中所衍生的統(tǒng)計問題加以介紹,并介紹其中一些新的圖形工具用以呈現(xiàn)分析結(jié)果。
微陣列芯片即一般所謂的基因芯片,也是基因組計劃完成后衍生出來的產(chǎn)品,花費成本雖高,但效用無限,是目前所有生物芯片中應(yīng)用最廣的,由于近年來不斷改進,也是最有成效的生物技術(shù)。一般而言,基因芯片是利用微處理技術(shù),先把人類所有的基因分別固著在一小范圍的玻璃片(glass slide)、薄膜(membrane)或者硅芯片上;然后,可以平行地、大量地、全面性地偵測基因組中mRNA的量,也就是偵測基因的調(diào)控及相互作用表達。
對部分功能進行了優(yōu)化。