輕松學(xué)用生物軟件是一個(gè)多平臺(tái)開源軟件，主要目的是協(xié)助缺乏生物信息學(xué)經(jīng)驗(yàn)的分子生物學(xué)家管理、分析和可視化他們的數(shù)據(jù)。UGENE在一個(gè)常見用戶界面中整合了廣泛使用的生物信息學(xué)工具。該工具包支持多種生物學(xué)數(shù)據(jù)格式，并允許從遠(yuǎn)程數(shù)據(jù)來(lái)源檢索數(shù)據(jù)。d7V紅軟基地

軟件功能

它提供了生物學(xué)對(duì)象（例如帶注釋的基因組序列、下一代測(cè)序（Next Generation Sequencing，NGS）裝配數(shù)據(jù)，多重序列比對(duì)，系統(tǒng)發(fā)生樹和三維結(jié)構(gòu)）的可視化模塊。大部分整合的算法被調(diào)整以通過使用多線程和專用處理器指令發(fā)揮最大性能。UGENE包括一個(gè)可視化環(huán)境以創(chuàng)建能夠在本地資源或在一個(gè)高性能計(jì)算（High Performance Computing，HPC）環(huán)境中啟動(dòng)的可重用流程。UGENE使用Qt框架以C++編寫。內(nèi)置的插件系統(tǒng)和結(jié)構(gòu)化UGENE API使得可以用新的功能擴(kuò)展該工具包。d7V紅軟基地

軟件特色

unipro是一個(gè)多平臺(tái)開源軟件，其主要目標(biāo)是幫助分子生物學(xué)家在生物信息學(xué)中沒有太多的專業(yè)知識(shí)來(lái)管理、分析和可視化他們的數(shù)據(jù)。ugene集成了廣泛使用的生物信息學(xué)工具在一個(gè)通用的用戶界面中。該工具包支持多種生物數(shù)據(jù)格式，允許從遠(yuǎn)程數(shù)據(jù)源檢索數(shù)據(jù)。它提供了生物對(duì)象的可視化模塊，如注釋的基因組序列、新一代測(cè)序匯編數(shù)據(jù)。d7V紅軟基地

軟件說明

1、基因芯片綜合分析軟件。 d7V紅軟基地
ArrayVision 7.0 一種功能強(qiáng)大的商業(yè)版基因芯片分析軟件，不僅可以進(jìn)行圖像分析，還可以進(jìn)行數(shù)據(jù)處理，方便protocol的管理功能強(qiáng)大，商業(yè)版正式版：6900美元。 d7V紅軟基地
Arraypro 4.0 Media Cybernetics公司的產(chǎn)品，該公司的gelpro， imagepro一直以精確成為同類產(chǎn)品中的佼佼者，相信arraypro也不會(huì)差。 d7V紅軟基地
phoretix™ Array Nonlinear Dynamics公司的基因片綜合分析軟件。 d7V紅軟基地
J-express 挪威Bergen大學(xué)編寫，是一個(gè)用JAVA語(yǔ)言寫的應(yīng)用程序，界面清晰漂亮，用來(lái)分析微矩陣（microarray）實(shí)驗(yàn)獲得的基因表達(dá)數(shù)據(jù)，需要下載安裝JAVA運(yùn)行環(huán)境JRE1.2后(5.1M)后，才能運(yùn)行。d7V紅軟基地
2、 基因芯片閱讀圖像分析軟件d7V紅軟基地
ScanAlyze 2.44 ，斯坦福的基因芯片基因芯片閱讀軟件，進(jìn)行微矩陣熒光圖像分析，包括半自動(dòng)定義格柵與像素點(diǎn)分析。輸出為分隔的文本格式，可很容易地轉(zhuǎn)化為任何數(shù)據(jù)庫(kù)。d7V紅軟基地
3、 基因芯片數(shù)據(jù)分析軟件d7V紅軟基地
Cluster 斯坦福的對(duì)大量微矩陣數(shù)據(jù)組進(jìn)行各種簇（Cluster）分析與其它各種處理的軟件。 d7V紅軟基地
SAM Significance Analysis of Microarrays 的縮寫，微矩陣顯著性分析軟件，EXCEL軟件的插件，由Stanford大學(xué)編制。d7V紅軟基地
4．基因芯片聚類圖形顯示 d7V紅軟基地
TreeView 1.5 斯坦福開發(fā)的用來(lái)顯示Cluster軟件分析的圖形化結(jié)果�，F(xiàn)已和Cluster成為了基因芯片處理的標(biāo)準(zhǔn)軟件。 d7V紅軟基地
Freeview 是基于JAVA語(yǔ)言的系統(tǒng)樹生成軟件，接收Cluster生成的數(shù)據(jù)，比Treeview增強(qiáng)了某些功能。d7V紅軟基地
5．基因芯片引物設(shè)計(jì)d7V紅軟基地
Array Designer 2.00 DNA微矩陣（microarray）軟件，批量設(shè)計(jì)DNA和寡核苷酸引物工具。d7V紅軟基地

軟件截圖

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