RNA結(jié)構(gòu)分析(FlexNovo)是模擬配體預(yù)測和�？康幕顒�(dòng)站點(diǎn)上下文中的大片段FlexNovo 是一個(gè)簡單和容易使用的命令行實(shí)用工具，它使您能夠輕松地分析結(jié)構(gòu)圖案和蛋白的 RNA。FlexNovo 基于 FlexX 技術(shù)，是一種分子的RNA結(jié)構(gòu)分析實(shí)用程序，使您能夠查看的片段，演變以及化學(xué)配體的理化和幾何屬性。Kyv紅軟基地

軟件功能

它使您能夠輕松地分析結(jié)構(gòu)圖案和蛋白的 RNA。FlexNovo 基于 FlexX 技術(shù)，是一種分子的RNA結(jié)構(gòu)分析實(shí)用程序，使您能夠查看的片段，演變以及化學(xué)配體的理化和幾何屬性。Kyv紅軟基地

軟件特色

1、原始數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)Kyv紅軟基地
2、過濾掉低質(zhì)量reads后的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)Kyv紅軟基地
3、高級生物信息分析結(jié)果報(bào)告。Kyv紅軟基地

軟件說明

RNA結(jié)構(gòu)分析(FlexNovo)是利用Trinity (Version: r2011-08-20) 進(jìn)行de novo assembly， Trinity參數(shù)：--min_kmer_cov 2 -- min_contig_length 100 --run_butterfly。拼接后的轉(zhuǎn)錄本，通過PERL腳本去冗余，在同一個(gè)component ID的序列中選擇最長的一個(gè)isoform代表該locus的轉(zhuǎn)錄本，得到Unigene集。Kyv紅軟基地

軟件截圖

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