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這是分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)ppt,包括了堿裂解法小量制備質(zhì)粒DNA,感受態(tài)細(xì)胞制備,質(zhì)粒轉(zhuǎn)化,聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR),實(shí)驗(yàn)?zāi)康,?shí)驗(yàn)原理,實(shí)驗(yàn)材料,實(shí)驗(yàn)方法,實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析,思考題等內(nèi)容,歡迎點(diǎn)擊下載。
分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)ppt是由紅軟PPT免費(fèi)下載網(wǎng)推薦的一款課件PPT類型的PowerPoint.
一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康? 掌握堿裂解法提取質(zhì)粒的方法 二、實(shí)驗(yàn)原理 分離質(zhì)粒DNA方法 堿變性法 煮沸法 SDS法 羥基磷灰石層析法等 各方法分離是依據(jù)宿主菌株類型、質(zhì)粒分子大小、堿基組成及結(jié)構(gòu)等特點(diǎn)加以選擇的,其中堿變性法既經(jīng)濟(jì)且收得率較高,提取的質(zhì)粒DNA可用于酶切,連接與轉(zhuǎn)化 堿變性法基本原理 在pH 12.0-12.6堿性環(huán)境中,線性的大分子量細(xì)菌染色體DNA變性,而共價(jià)閉環(huán)質(zhì)粒DNA仍為自然狀態(tài) 將PH調(diào)至中性并有高鹽濃度存在的條件下,染色體DNA之間交聯(lián)形成不溶性網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),大部分DNA和蛋白質(zhì)在去污劑SDS的作用下形成沉淀,而質(zhì)粒DNA仍為可溶狀態(tài),通過(guò)離心可除去大部分細(xì)胞碎片、染色體DNA、RNA及蛋白質(zhì),質(zhì)粒DNA尚在上清中,再用酚氯仿抽提進(jìn)一步純化質(zhì)粒DNA 三、實(shí)驗(yàn)材料 實(shí)驗(yàn)試劑 LB培養(yǎng)基: 胰化蛋白胨 10g 酵母提取物 5g 定容 1000ml pH7.5 NaCl 10g STE: 0.1M NaCl 10mM Tris HCl(pH8.0) 1mM EDTA AmP 50mg/ml 溶菌酶 10mg/ml (用10mM Tris·HCl pH8.0新鮮配制) 溶液Ⅰ: 50mM 葡萄糖 25mM Tris·HCl(pH8.0) 10mM EDTA 溶液Ⅱ:(新鮮配制) 0.2N NaOH 1% SDS 溶液Ⅲ: 5M KAC 10ml 冰醋酸 11.5ml 水 28.5ml 酚,氯仿,乙醇 RNase 瓊脂糖 TE: 10mM Tris-HCl(pH8.0) 1mM EDTA 四、實(shí)驗(yàn)方法 1.挑取瓊脂培養(yǎng)板上的單菌落至5ml LB培養(yǎng)液中(含AmP 50μg/ml), 37℃強(qiáng)烈搖蕩過(guò)度 2.取1.5ml培養(yǎng)液至Eppendorf管中,12000g離心30秒,棄上清,用1ml STE懸浮菌體,再離心回收菌體,并重復(fù)一次,棄上清,取沉淀 3.將細(xì)菌沉淀懸浮于100μl預(yù)冷溶液Ⅰ中,振蕩混勻,冰上放置5分鐘 四、實(shí)驗(yàn)方法 4.加入200μl溶液Ⅱ,蓋嚴(yán)管蓋輕柔顛倒以混勻內(nèi)容物,冰上放置5分鐘 5.加入150μl溶液Ⅲ,溫和振蕩數(shù)次,冰上放置5分鐘 6.12000g 4 ℃離心5分鐘,取上清移到1個(gè)新的Eppendorf管中 7.加入等體積酚/氯仿(1:1),振蕩混勻,12000g 4 ℃離心2分鐘。取上清移至另1個(gè)Eppendorf管中 8.加入2倍體積無(wú)水乙醇,振蕩混勻,于室溫靜置2分鐘。 9.12000g ,4 ℃離心5分鐘。 10.棄上清,加入1ml 70%乙醇漂洗沉淀,蓋嚴(yán)管蓋顛倒數(shù)次,12000g 4 ℃離心2分鐘。 11.棄上清,抽干乙醇,室溫干燥(5-15分鐘)。 12.加入50μl TE(含20μg/ml RNA 酶,不含DNA酶)溶解DNA。 13.取10μl DNA溶解液用TE稀釋至1000ul測(cè)定OD260和OD280,計(jì)算OD260/OD2 80之比 14.同時(shí)以以下公式計(jì)算得率 質(zhì)粒DNA得率: 稀釋倍數(shù)×OD260×0.05×50/1.5ml 15.取10μl DNA溶解液加2μl Loading buffer于1%瓊脂糖,電泳3小時(shí),電壓40伏。 16.電泳凝膠在透射式紫外檢測(cè)儀上觀察,記錄結(jié)果 五、實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析 1.根據(jù)質(zhì)粒DNA OD260,OD280值,計(jì)算質(zhì)粒DNA得率和DNA純度 2.記錄電泳結(jié)果并說(shuō)明結(jié)果內(nèi)容 六、思考題 1.簡(jiǎn)要敘述溶液Ⅰ、溶液Ⅱ和溶液Ⅲ的作用,以及實(shí)驗(yàn)中 分別加入上述溶液后,反應(yīng)體系出現(xiàn)的現(xiàn)象及其成因 2.簡(jiǎn)要敘述酚氯仿抽提DNA體系后出現(xiàn)的現(xiàn)象及其成因 實(shí)驗(yàn)二 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?學(xué)習(xí)氯化鈣法制備大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞的方法 實(shí)驗(yàn)原理 感受態(tài):細(xì)菌能夠吸收外源DNA的生理狀態(tài)稱為感受態(tài) 細(xì)菌經(jīng)低滲氯化鈣處理后,細(xì)胞膨脹、細(xì)胞膜的通透性發(fā)生變化,成為能容許外源DNA分子通過(guò)細(xì)胞的狀態(tài) 本實(shí)驗(yàn)以 E.coli DH5α 菌株為受體細(xì)胞,用 CaCl2 處理受體菌使其處于為感受態(tài) 實(shí)驗(yàn)儀器 實(shí)驗(yàn)試劑 大腸桿菌DH5α LB培養(yǎng)基, 0.1mol/LCaCl2溶液(預(yù)冷) 實(shí)驗(yàn)步驟 菌株活化 感受態(tài)細(xì)胞制備 實(shí)驗(yàn)步驟 菌株活化 1.用接種環(huán)直接取凍存的大腸桿菌DH5α,在LB培養(yǎng)基平板表面劃線,于37℃培養(yǎng)16小時(shí) 2.挑取一個(gè)單菌落,轉(zhuǎn)到3-5mlLB培養(yǎng)基中,于37℃培養(yǎng)3-5小時(shí) 3.將培養(yǎng)液全部轉(zhuǎn)到100mlLB培養(yǎng)基中培養(yǎng)2-3小時(shí),到OD600=0.3-0.4 感受態(tài)細(xì)胞制備 4.將培養(yǎng)液轉(zhuǎn)入1.5ml離心管中,在冰上放置15-30min 5.6000rpm離心10min,棄上清 6.加入0.3ml預(yù)冷的0.1mol/l CaCl2,懸浮沉淀,冰上預(yù)冷10min 7.4000rpm離心5 min,棄上清 8.加入0.2ml預(yù)冷含有甘油的0.1mol/l CaCl2,懸浮沉淀,即為感受態(tài)細(xì)胞,可-70℃長(zhǎng)期保存 實(shí)驗(yàn)三 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?1.了解轉(zhuǎn)化的概念及其在分子生物學(xué)研究中的意義 2.學(xué)習(xí)將外源質(zhì)粒 DNA 轉(zhuǎn)入受體菌細(xì)胞并篩選轉(zhuǎn)化體的方法 轉(zhuǎn)化 將外源 DNA 分子引入受體細(xì)胞,使受體細(xì)胞獲得新的遺傳性狀的一種手段,它是微生物遺傳、分子遺傳、基因工程等研究的基本實(shí)驗(yàn)技術(shù) 常用轉(zhuǎn)化方法 電擊法 CaCl2、RuCl等化學(xué)試劑法 實(shí)驗(yàn)原理 本實(shí)驗(yàn)以 E.coli DH5α 菌株為受體細(xì)胞,用 CaCl2 處理受體菌使其處于為感受態(tài),加入 pUC18質(zhì)粒,在鈣離子的作用下,質(zhì)粒與鈣離子形成復(fù)合物吸附在細(xì)菌細(xì)胞表面,經(jīng)42℃短暫熱刺激,細(xì)胞膜通透性增大,可吸收吸附的質(zhì)粒DNA,即實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)化 實(shí)驗(yàn)原理 pUC18質(zhì)粒攜帶有抗氨芐青霉素的基因,接受該質(zhì)粒的受體菌具有抗氨芐青霉的特性。將轉(zhuǎn)化后的受體細(xì)胞于含氨芐青霉素平板培養(yǎng)基上培養(yǎng),只有轉(zhuǎn)化體才能存活,而未受轉(zhuǎn)化的受體細(xì)胞則因無(wú)抵抗氨芐青霉素的能力而死亡 影響轉(zhuǎn)化率的因素 細(xì)胞生長(zhǎng)狀態(tài)和密度 轉(zhuǎn)化的質(zhì)粒DNA質(zhì)量、濃度 試劑的質(zhì)量 防止雜菌和其它外源DNA污染 實(shí)驗(yàn)儀器 實(shí)驗(yàn)試劑 感受態(tài)細(xì)胞大腸桿菌DH5α LB培養(yǎng)基, 0.1mol/LCaCl2溶液(預(yù)冷) 氨芐青霉素 pUC18質(zhì)粒 實(shí)驗(yàn)步驟 1. 取目的DNA加入大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞中,于冰上放置30min 2. 于42℃水浴90S 3. 冰上放置2min 4. 加入1ml LB液體培養(yǎng)基于37℃培養(yǎng)1小時(shí) 實(shí)驗(yàn)步驟 5. 3000rpm離心2min 6. 吸出上清液0.8ml,將剩余液體輕輕吸打、混合均勻 7. 將培養(yǎng)液均勻涂布在含Amp+的培養(yǎng)基平板上 8. 將平板放置于37℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)12-14個(gè)小時(shí),然后觀察結(jié)果 對(duì)照組 轉(zhuǎn)化率 思考題 分子生物學(xué)中常用的載體有哪些 實(shí)驗(yàn)步驟第4步加入1ml LB液體培養(yǎng)基于37℃培養(yǎng)1小時(shí)的作用是什么 實(shí)驗(yàn)四 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR) 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?通過(guò)本實(shí)驗(yàn)學(xué)習(xí)PCR反應(yīng)基本原理與實(shí)驗(yàn)技術(shù) 實(shí)驗(yàn)原理 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR),是一種在體外快速擴(kuò)增特定基因或DNA序列的方法,故又稱為基因的體外擴(kuò)增法。 在待擴(kuò)增的DNA片斷兩側(cè)和與其兩側(cè)互補(bǔ)的兩個(gè)寡核苷酸引物,經(jīng)變性、退火和延伸若干個(gè)循環(huán)后,DNA擴(kuò)增2n倍。 PCR技術(shù)原理 1.變性:在加熱或堿性條件下可使DNA雙螺旋的氫鍵斷裂,形成單鏈DNA,稱之為變性 2.退火:是模板與引物的復(fù)性。引物是與模板某區(qū)序列互補(bǔ)的一小段DNA片段 3.延伸:從結(jié)合在特定DNA模板上的引物為出發(fā)點(diǎn),將四種脫氧核苷酸以堿基配對(duì)形式按5’→3’的方向沿著模板順序合成新的DNA鏈 實(shí)驗(yàn)儀器 實(shí)驗(yàn)材料 1、DNA模板 2、4種dNTP 3、引物1、引物2 4、Taq酶 5、瓊脂糖 6、DNA相對(duì)分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)物 7、吸頭、50ul PCR管 試劑 10×PCR緩沖液(含Mg2+) 4×dNTP (每種1mmol) Tag酶 1U/ul DNA模板 引物1: 5`- GGGGAATTCATGGTGAGCAAGGGC-3` 引物2: 5`-GACCTGCAGGCATGCAAGCTTGGC-3` 引物溶液濃度 10pmol/ul 實(shí)驗(yàn)步驟 在0.5ml RCR管內(nèi)配置20ul反應(yīng)體系: PCR反應(yīng)程序 (1) 94℃變性5min, (2) 94℃變性1min, (3) 52 ℃退火1min, (4) 72 ℃延伸1min。 (5) 重復(fù)(2)-(4)30次 (6)72 ℃延伸1min。 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
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